Korzenie i protoplaści (1907–1997)
Historia Podbeskidzia sięga początków XX wieku. Już w 1907 roku w Bielsku powstał Bielitzer Fussball Klub – najstarszy klub sportowy na Śląsku Cieszyńskim, później znany jako BBTS. Przez dekady BBTS występował głównie w rozgrywkach regionalnych, będąc ważnym elementem sportowej tożsamości miasta. Drugim filarem przyszłego Podbeskidzia był Włókniarz Bielsko-Biała, wywodzący się z klubu Biała Lipnik, założonego w 1910 roku.
Na piłkarskiej mapie miasta istniał także Inter Bielsko-Biała oraz DKS Komorowice – kluby, które odegrały kluczową rolę w późniejszych fuzjach.

Powstanie Podbeskidzia (1997)
W 1997 roku, po serii spadków bielskich drużyn, działacze zdecydowali się na połączenie sił. 11 lipca 1997 roku, w wyniku fuzji sekcji piłkarskiej BBTS Włókniarz z DKS Inter Komorowice, powstał klub będący bezpośrednim protoplastą dzisiejszego Podbeskidzia. Był to początek dynamicznego rozwoju nowej drużyny.

Droga w górę (1997–2002)
Nowy klub szybko zaczął piąć się po szczeblach ligowych. W ciągu pięciu lat awansował z klasy okręgowej aż do II ligi, ustanawiając po drodze liczne rekordy i dominując w rozgrywkach regionalnych. W 2002 roku zespół stał się pierwszą od wielu lat drużyną z Bielska-Białej grającą na szczeblu centralnym.

Narodziny Podbeskidzia i stabilizacja (2002–2008)
W 2002 roku klub przyjął nazwę Podbeskidzie Bielsko-Biała, podkreślając regionalny charakter i tożsamość „Górali”. Drużyna zadomowiła się w II lidze, mimo problemów finansowych i konsekwencji afery korupcyjnej, która zahamowała sportowy rozwój, ale nie doprowadziła do upadku klubu.

Od zaplecza elity do Ekstraklasy (2008–2011)
Po reformie lig Podbeskidzie grało w I lidze, stopniowo budując silny zespół. Sezon 2010/2011 okazał się przełomowy – „Górale” wywalczyli historyczny awans do Ekstraklasy, po raz pierwszy w dziejach bielskiej piłki.

Lata w Ekstraklasie (2011–2016)
Podbeskidzie przez pięć sezonów występowało w najwyższej klasie rozgrywkowej. Klub zasłynął z ambitnej gry i świetnej atmosfery na Stadionie Miejskim. Najlepszym sezonem był 2013/2014, zakończony na 10. miejscu. W 2016 roku Podbeskidzie po raz pierwszy spadło z Ekstraklasy.

Powroty i spadki (2016–2024)
Po degradacji „Górale” występowali w I lidze, w 2020 roku ponownie awansując do Ekstraklasy. Pobyt w elicie trwał jednak tylko jeden sezon. W kolejnych latach klub rywalizował na zapleczu najwyższej klasy rozgrywkowej, aż w sezonie 2023/2024 spadł na trzeci poziom ligowy.

Podbeskidzie Bielsko-Biała to klub o długich i złożonych tradycjach, który z lokalnych fuzji wyrósł na rozpoznawalną markę polskiej piłki, wielokrotnie udowadniając zdolność do odbudowy mimo sportowych i organizacyjnych trudności.