Historia Skry Częstochowa sięga 1926 roku, gdy na bazie amatorskich zespołów z dzielnicy Ostatni Grosz powstał Robotniczy Klub Sportowy Skra. Klub był silnie związany z ruchem robotniczym i środowiskiem PPS oraz TUR. Już w okresie międzywojennym Skra należała do czołówki częstochowskiej piłki, a jej zawodnicy – m.in. Stanisław Kołodziejczyk – trafiali do szerokiej kadry olimpijskiej.
II wojna światowa przyniosła klubowi ogromne straty – wielu zawodników i działaczy zginęło w egzekucjach i obozach koncentracyjnych. Po wojnie Skra szybko odbudowała swoją pozycję, rywalizując w mistrzostwach Polski i ligach centralnych. W kolejnych dekadach klub wielokrotnie zmieniał nazwę (Ogniwo, Sparta), balansując między III a IV ligą.
Nowy rozdział otwarto po 2000 roku, a kluczowym momentem była fuzja z Orłem Psary-Babienica w 2011 roku. Skra przejęła jego miejsce w III lidze i rozpoczęła marsz w górę. Kulminacją był awans do I ligi w 2021 roku, po barażach wygranych w Kaliszu. Po kilku sezonach na zapleczu Ekstraklasy klub ponownie spadł – najpierw do II ligi (2023), a następnie do III ligi (2025).